董晨 , 魏永赞 , 王弋 , 郑雪文 , 李伟才^*

中国热带农业科学院南亚热带作物研究所, 农业部热带果树生物学重点实验室, 湛江, 524091
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2019 年, 第 17 卷, 第 8 篇   
收稿日期: 2018年01月04日    接受日期: 2018年02月25日    发表日期: 2019年08月08日

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为了研究木葡聚糖内切葡聚糖酶/水解酶(xyloglucan endotransglucosylase/hydrolase, XTH)基因家族在荔枝花穗发育过程中的分布及表达情况，本研究基于‘妃子笑’荔枝花穗转录组数据，利用生物信息学研究方法，首次对‘妃子笑’荔枝 XTH 基因家族进行鉴定，包括基因的基本物理和化学特征，亚细胞定位，蛋白质保守结构域，进化关系和表达模式。结果表明：LcXTH 基因家族成员有 29 个，其蛋白长度范围在 37~311 AA之间，对应的相对分子量范围在 4.398~35.711 kD 之间，等电点(pI)范围为 4.39~9.46。此外，亚细胞定位分析显示所有 LcXTH 蛋白均位于细胞壁；LcXTH 含有 2 个相对保守的结构域(Glyco_hydro_16 结构域和XET_C结构域)；系统发育树分析表明 LcXTH 基因家族分为四组(玉~郁组)，不同发育阶段 LcXTHF 基因的表达模式不同。本研究为进一步对 XTH 基因的功能研究提供理论依据。

荔枝(Litchi chinensis)；木葡聚糖内切葡聚糖酶 / 水解酶；基因家族；生物信息分析；表达分析